Como Institución respetable y de noble abolengo, el Liceo Naval se preocupó desde el inicio por acuñar sus símbolos y honrarlos como corresponde.

El primer símbolo en aparecer fue el Escudo. Su nacimiento se confunde con el de la Institución. Fue producto de una creación colectiva. Los elementos que lo integran no pueden ser más expresivos ni mejor seleccionados; y el todo resultante es un conjunto armónico, original y significativo. Un ancla vertical y plateada sirve de fondo y sostén del conjunto; clara alusión al carácter naval del plantel, y a la seguridad y confianza que genera una educación regentada por la Armada.

El ancla está coronada por un cóndor con sus alas desplegadas, cobijando toda la estructura, con el mismo sentido de libertad y majestuosidad expresado en el Escudo de Armas del País. Sobre el cuerpo del ancla se inserta un campo ojival cortado, en cuyo medio superior, de color celeste, resalta un timón casi completo, que marca el rumbo a la esperanza, a la infinitud, a la transparencia y al optimismo.

El medio inferior, azul profundo, recibe, sobre un oleaje de vitalidad, de cambio y trabajo, un libro abierto, en cuyas páginas están marcadas las letras mayúsculas griegas Lambda y Omega, de tanta utilidad en la ciencia de la navegación marítima. Atada a los brazos inferiores del ancla flamea con libertad y orgullo una cinta con fondo rojo que lleva la inscripción CIENCIA - HONOR - DISCIPLINA, que es el lema del quehacer diario del Liceo Naval de Guayaquil. Este es el Escudo que sintetiza el espíritu naval, educativo, nacionalista, caballeroso y emprendedor de la Unidad Educativa Liceo Naval "Cmdte.Rafael Andrade Lalama"